Names
X
Name
Species
Main
ATRX 
Homo sapiens, Mus musculus 
True 
F9/18D6 
Mus musculus 
False 
Xnp 
Mus musculus 
False 
Keywords
X
chromatin assembly, telomere, acrocentric, ATPase, bromodomain, cancer, chromatin remodelling, gene trap, genetic disease, helicase, mitotic chromosomes, PML bodies, rDNA, swi_snf, PxVxL, histone chaperone, inactive X, PHD finger, H3K9me3 binding, alt telomere pathway, macroH2A, transcription elongation
Location
X
Location
Species
Xq13.3 
Homo sapiens 
X 
Mus musculus 
Subcellular Localisation
X
Stage
Description
Details
Links
Interphase 
centromere 
gene-trap and I.f. 
PubMed:11555636
PubMed Central:10570185
Mitosis 
centromere 
gene-trap and I.f. 
PubMed:11555636
PubMed Central:10570185
Mitosis 
heterochromatin 
gene-trap and I.f. 
PubMed:10742099
PubMed:11555636
PubMed Central:10570185
Interphase 
heterochromatin 
gene-trap 
PubMed:11555636
Interphase 
ribosomal loci 
 
PubMed:10742099
Interphase 
PML/ND10 bodies 
with Daxx 
PubMed:12953102
pubmed:17957225
meiosis 
heterochromatin 
 
PubMed:15242786
Interphase 
inactive X 
 
pubmed:19005673
Protein Sequence
X
MwPredict
PIPredict
MwActual
PIActual
AANo
Links
278.6 
6.27 
 
 
2476 
PubMed:11555636
PubMed:9545503
PubMed:17609377
Entrez Nucleotide:AF026032
PubMed Central:10570185
Uniprot:Q61687
284.3 
6.23 
 
 
2492 
Entrez Protein:P46100
PubMed:14729260
PubMed:12858175
OMIM:301040
OMIM:300032
genelynxhs:8674
Uniprot:P46100
Annotation
X
Start
End
Domain
Description
80 
83 
NLS 
 
219 
271 
PHD finger 
InterPro 
220 
268 
RING finger 
smart prediction 
694 
700 
NLS 
 
780 
809 
NLS BP 
 
955 
1003 
NLS BP 
 
1080 
1096 
NLS BP 
 
1128 
1131 
NLS 
 
1258 
1264 
NLS 
 
1294 
1297 
NLS 
 
1356 
1371 
NLS BP 
 
1408 
1424 
NLS BP 
 
1435 
1441 
NLS 
 
1465 
1468 
NLS 
 
1556 
1776 
DEAD box 
 
1563 
1889 
SNF2 N term 
 
1891 
1895 
NLS 
 
2069 
2155 
Helicase 
 
2180 
2188 
NLS 
 
1 
1224 
gene trap insertion 
GT insert after aa 1224 (CQSS/G) 
1 
2476 
full length 
 
80 
83 
NLS 
 
219 
267 
PHD finger 
 
219 
267 
RING finger 
 
391 
429 
coiled-coil 
PSORT prediction 
682 
688 
NLS 
 
760 
764 
NLS 
 
762 
769 
NLS BP 
 
775 
791 
NLS BP 
 
787 
790 
NLS 
 
934 
950 
NLS BP 
 
968 
974 
NLS 
 
1106 
1110 
NLS 
 
1173 
1179 
NLS 
 
1319 
1322 
NLS 
 
1395 
1411 
NLS BP 
 
1409 
1414 
NLS 
 
1422 
1511 
coiled-coil 
PSORT prediction 
1458 
1464 
NLS 
 
1488 
1491 
NLS 
 
1600 
2170 
Helicase 
 
1912 
1921 
NLS 
 
2201 
2209 
NLS 
 
2303 
2330 
coiled-coil 
PSORT prediction 
Biological Process
X
GO ID
Term
Links
GO:0006338 
chromatin remodeling 
PubMed:12953102
PubMed Central:17296936
GO:0006306 
DNA methylation 
PubMed:10742099
GO:0009790 
embryonic development 
PubMed:16628246
GO:0007059 
chromosome segregation 
PubMed:15242786
GO:0030900 
forebrain development 
PubMed Central:15668733
GO:0006357 
regulation of transcription from Pol II promoter 
PubMed:15358626
GO:0031507 
heterochromatin formation 
pubmed:18461125
pubmed: 20885787
GO:0000723 
telomere maintenance 
pubmed:20110566
pubmed: 21719641
pubmed:22829774
GO:0000122 
chromatin silencing 
pubmed:20159591
GO:0031497 
chromatin assembly 
pubmed:20211137
pubmed: 20504901
pubmed:22391447
GO:0007126 
meiosis 
pubmed: 20885787
GO:0006368 
transcription elongation from RNA polymerase II promoter 
pubmed:25452430
GO:0000724 
double-strand break repair via homologous recombination 
pubmed:33431668
Molecular Function
X
GO ID
Term
Links
GO:0008026 
ATP-dependent helicase activity 
PubMed:12953102
GO:0003682 
chromatin binding 
PubMed:15882967
PubMed Central:10570185
GO:0003762 
histone-specific chaperone activity 
pubmed:20211137
GO:0035064 
methylated histone residue binding 
pubmed:21421568
pubmed:21666679
Other Function
X
Function
Links
mental retardation 
PubMed:10632111
Expression
X
Experiment
Detail
Links
Related Genes
X
Name
Species
Links
atry 
Homo sapiens 
PubMed Central:11069290
snf2 
Mus musculus 
rad54 
Saccharomyces cerevisiae 
History
X
Created On
Last Changed
2000-12-06 14:59:49 
2007-02-12 10:06:41